Primeiro você deve cadastrar essa empresa matriz no sistema, acessando Arquivos > Empresas > Empresas e clique em Inserir.
Cadastre a empresa e marque/preencha o checkbox Essa empresa é matriz e está sendo contabilizada por outro escritório contábil.
Acesse o cadastro da empresa filial, acessando Arquivos > Empresas > Empresas, localizando essa empresa e colocando o apelido da Matriz no campo Matriz.
Na Central de Comunicação, aba Habilitar Empresas, esse grupo de matriz/filial vai ser identificado com uma faixa vermelha, e na coluna Matriz vai ter o desenho de um prédio, dando um duplo clique sobre esse prédio abrirá uma tela mostrando as filiais que estão vinculadas a essa matriz.
Nessa situação de matriz contabilizada por outro escritório não será dado gatilho em nenhum evento que leve informações da matriz e não será dado gatilho no evento S-1000 porque ele é de responsabilidade da matriz.
Para fechamento da folha, após o cálculo, você deverá acessar Cálculos > Encerramento > Mensal > Individual (Pagamento), fazer o encerramento dos funcionários e enviar os eventos S-1200 e S-1210.
O evento S-1299 é de responsabilidade de envio apenas da Matriz, sendo assim o sistema não fará gatilho e envio desse evento.
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