O ideal é identificar primeiro onde consta a diferença dos lançamentos, se na Gia ou na EFD.
Para identificar qual campo ajustar é possível consultar algumas mensagens através do link: Eliminação da GIA - Principais Divergências e Inconsistências (link para uma nova aba)
Segue um exemplo de notificação do DEC:
CF04 =
Neste caso por exemplo observe que o valor da GIA está menor que o valor da EFD. Neste caso terei que conferir este CFOP nas duas declarações(referente aos valores), ajustar os lançamentos e transmitir a EFD novamente ou a GIA se for o caso.
CF07 =
Nesta outra mensagem, pode observar que a GIA não tem estes valores informados, então nesta situação terá que comparar os valores referente a estes CFOPS e retificar.
Relativo a